32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0044 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  68.36 
 
 
247 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  51.52 
 
 
307 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  46.43 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  46.88 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  34.94 
 
 
243 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  36.51 
 
 
255 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  36.65 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  37.65 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  31.75 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  37.04 
 
 
255 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  33.6 
 
 
250 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  38.87 
 
 
247 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  35.74 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  39.52 
 
 
243 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  34.19 
 
 
249 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  36.22 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  33.68 
 
 
253 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  35.41 
 
 
247 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  35.38 
 
 
247 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  34.87 
 
 
247 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  31.41 
 
 
237 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  34.01 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  30.92 
 
 
237 aa  89.7  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  32.31 
 
 
237 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  33.5 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  35.42 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  32.81 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  32.45 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  31.71 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  37.72 
 
 
305 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>