More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1280 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  73.75 
 
 		 83 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  73.75 
 
 		 83 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 82 aa  110  9e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1034  50S ribosomal protein L27  68.06 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0754861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  68.42 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  60.49 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  65.79 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  70.83 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  65.28 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  67.14 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  68.57 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  58.54 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>