109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0174 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0174  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  100 
 
 		 119 aa  239  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2140  hypothetical protein  43.97 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0918  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  44.55 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0340  ferredoxin  40.34 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000592647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0098  ferredoxin-like protein  43.44 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000332289 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3803  hypothetical protein  42.74 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2234  ferredoxin  43.1 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 619 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1297  hypothetical protein  41.03 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0912  ferredoxin-like protein  41.88 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0934  ferredoxin-like protein  41.88 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0994  ferredoxin-like protein  40.52 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1171  ferredoxin-like protein  33.04 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0148  NADP-reducing hydrogenase chain B  35.59 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0725  NADH dehydrogenase (quinone)  40.71 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1603  NADP-reducing hydrogenase chain B  33.63 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1635  NADP-reducing hydrogenase chain B  28.32 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000061136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1845  NADP-reducing hydrogenase chain B  30.09 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3517  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  30.28 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  32.71 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  37.21 
 
 		 604 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 619 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 		 588 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  28.81 
 
 		 575 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.61 
 
 		 634 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.12 
 
 		 677 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 562 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 		 632 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 		 562 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 602 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  33.77 
 
 		 617 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 		 607 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 		 607 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 569 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  27.34 
 
 		 627 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 		 596 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  30.84 
 
 		 626 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  30.84 
 
 		 626 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  29.63 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  39.08 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 		 595 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 		 562 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  33.72 
 
 		 597 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 623 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  25.89 
 
 		 614 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  30.59 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  30.85 
 
 		 569 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 		 604 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 		 598 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.75 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 		 592 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  30.51 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 		 543 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.03 
 
 		 623 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.12 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28 
 
 		 636 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.93 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  31.94 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 		 597 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 		 636 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  29.59 
 
 		 570 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  26.4 
 
 		 624 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  26.72 
 
 		 572 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  31.25 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  30.26 
 
 		 629 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  30.56 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  25.26 
 
 		 570 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  32.39 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  30.56 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 594 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 		 620 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  30.49 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  27.96 
 
 		 552 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  30.88 
 
 		 105 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  26.19 
 
 		 596 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  28.23 
 
 		 628 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  27.12 
 
 		 614 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.57 
 
 		 109 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  27.5 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  24.17 
 
 		 624 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.21 
 
 		 162 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 593 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  28.99 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  29.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  27.63 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  27.62 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 		 596 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 		 539 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.14 
 
 		 597 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  28.85 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  22.88 
 
 		 572 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  29.33 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  29.27 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  29.33 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  29.27 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  29.27 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 		 590 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>