More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1011 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  70.07 
 
 		 146 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  70.07 
 
 		 146 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  68.84 
 
 		 146 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  68.61 
 
 		 174 aa  200  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  69.23 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  52.71 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  53.12 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  50.78 
 
 		 165 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  50.78 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  50.74 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  50.78 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  50.79 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  54.55 
 
 		 139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  53.72 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  52.07 
 
 		 136 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  49.22 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  49.23 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  49.23 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  50.4 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  51.15 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  49.6 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  49.21 
 
 		 171 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  49.6 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  47.69 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  49.6 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  48 
 
 		 195 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  48.8 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  52.17 
 
 		 208 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  45.71 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  49.6 
 
 		 166 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  49.6 
 
 		 166 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 		 164 aa  105  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  40.48 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  45.24 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  38.14 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  44.55 
 
 		 161 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  41.22 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  41.73 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  37.17 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  34.11 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  33.91 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  35.4 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  35.4 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  36.28 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  36.28 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  36.28 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  36.28 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  36.28 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.04 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.04 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  35.71 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  35.35 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  33.04 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  33.98 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  29.77 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.44 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  33.66 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  29.84 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  30.63 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  38.05 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  36.78 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  29.23 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  34.12 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  30.89 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  35.71 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  35.71 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  27.78 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  33.96 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>