More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2863 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  149  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
113 aa  146  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
111 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
115 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  135  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  54.46 
 
 
112 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  56.25 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  130  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  130  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  52.68 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 
112 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 
112 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
114 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>