57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2622 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2622  BRO domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000919421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  48.39 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  31.54 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  41.18 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  40 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  35.59 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  32.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  41.18 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  35.79 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  37.38 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  28.04 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  41.18 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  37.5 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  35.79 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  37.5 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  35.05 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  33.98 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  33.98 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  28.85 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  32.43 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  31.31 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  32 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  31 
 
 		 313 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  32.22 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  31.68 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  32.41 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  30.85 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  32.29 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  35.87 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  34.41 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  36.14 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  35.58 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  33.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  33.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  35.58 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  30.56 
 
 		 256 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  32 
 
 		 134 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  34.52 
 
 		 256 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  27.84 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  34.07 
 
 		 111 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  26.6 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  32.58 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  26.74 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  30.21 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2805  prophage antirepressor-like  36.99 
 
 		 105 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0292574  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1196  prophage antirepressor  27.15 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  28.87 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  30.19 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  31.52 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  31.52 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  35.38 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  28.87 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  29.41 
 
 		 284 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  24.07 
 
 		 294 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  27.84 
 
 		 260 aa  41.6  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  26 
 
 		 284 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  25.4 
 
 		 263 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>