More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2221 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 158 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  59.09 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  54.94 
 
 		 176 aa  186  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  59.87 
 
 		 158 aa  183  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 		 158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  57.14 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  56.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  54.9 
 
 		 158 aa  173  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  55.56 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  53.95 
 
 		 156 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 		 166 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 157 aa  168  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  53.59 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  54.61 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  54.61 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  51.97 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  52.9 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  52.63 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  51.32 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  51.68 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  51.01 
 
 		 152 aa  160  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  49.03 
 
 		 163 aa  160  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2619  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 203 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 156 aa  158  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  50.66 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 159 aa  156  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 154 aa  154  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  50.65 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  50.34 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>