More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4038 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  56.03 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>