More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2459 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 462 aa  920    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  64.33 
 
 		 452 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  54.59 
 
 		 467 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  53.98 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  53.98 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  53.98 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  53.98 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  53.98 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  53.98 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  53.98 
 
 		 470 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  53.54 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  53.76 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  53.76 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  53.76 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  53.8 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  53.76 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  53.58 
 
 		 461 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  53.54 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  53.76 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0671  amino acid permease-associated region  52.78 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  53.88 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  54 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1594  aromatic amino acid transport protein  54.87 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  53.52 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  53.54 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  53.68 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  53.91 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  52.86 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  54.17 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  54.17 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  54.27 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  54.17 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  53.91 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  53.08 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  53.08 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  53.56 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  53.95 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  53.88 
 
 		 460 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  53.08 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  54.17 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  52.86 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  54.17 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0632  amino acid permease-associated region  53.08 
 
 		 448 aa  488  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  54.32 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1513  gamma-aminobutyrate permease  54.39 
 
 		 491 aa  488  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  52.85 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  54.34 
 
 		 447 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  52.83 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4269  amino acid permease-associated region  55.53 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  52.85 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  53.91 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4018  amino acid permease-associated region  56.31 
 
 		 461 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  53.91 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4349  amino acid permease-associated region  56.31 
 
 		 461 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  53.91 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  54.34 
 
 		 447 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  51.88 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  53.03 
 
 		 485 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  54.34 
 
 		 447 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  52.9 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  52.38 
 
 		 462 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  52.75 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4502  amino acid permease-associated region  54.32 
 
 		 461 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  52.75 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  53.52 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1671  amino acid transporter  56.31 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0584756  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  53.56 
 
 		 455 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  51.76 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  52.75 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  54.59 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6005  amino acid permease-associated region  56.08 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.44513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  54.15 
 
 		 471 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4232  amino acid permease-associated region  55.88 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4651  aromatic amino acid transport protein AroP2  52.34 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  52.65 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  53.36 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  53.5 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  52.51 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  52.87 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  52.64 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3758  amino acid permease-associated region  55.53 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.230663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53050  aromatic amino acid transport protein AroP2  52.13 
 
 		 472 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  55.34 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  52.64 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  52.64 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  52.42 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  53.35 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  51.19 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  51.19 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  51.19 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  51.19 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  52.42 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  51.19 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0164  aromatic amino acid transporter  52.51 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  55.12 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0163  aromatic amino acid transporter  52.51 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  52.42 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0171  aromatic amino acid transporter  52.51 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  52.42 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>