187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0136 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  51.69 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  55.7 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  46.34 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  46.99 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  44.3 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  45.12 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  47.37 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  44.58 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.57 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  42.86 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  48.1 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  46.84 
 
 		 81 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  43.21 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  45.57 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  42.17 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  45.57 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.21 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  38.64 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.77 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.57 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  44.3 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  41.77 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.19 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.77 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  46.05 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  45.12 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  45.12 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  38.55 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.42 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.42 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  40.23 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.51 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  46.91 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.17 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.67 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  34.85 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  40.62 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  39.06 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  40 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.55 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  39.06 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.55 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  37.18 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.06 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  38.75 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  40.74 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  38.96 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  36.36 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  45 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  40.26 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.14 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.8 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  35.06 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  35.44 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  36.71 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  37.66 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  33.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  37.18 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  36.71 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  35.06 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  35.9 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  38.75 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.57 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.24 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1369  RNA-binding S4 domain protein  34.69 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  39.24 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  30.68 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  36.71 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.83 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.8 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00885  heat shock protein 15  36.36 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.467007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>