More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0023 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  83.52 
 
 
795 aa  1338    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  84.67 
 
 
795 aa  1358    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  100 
 
 
796 aa  1603    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.43 
 
 
778 aa  327  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.75 
 
 
818 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 
757 aa  266  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.71 
 
 
840 aa  254  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.01 
 
 
794 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.37 
 
 
791 aa  238  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.8 
 
 
797 aa  238  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.97 
 
 
775 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.03 
 
 
786 aa  230  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.96 
 
 
789 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.38 
 
 
780 aa  219  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  31.89 
 
 
546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 
752 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.03 
 
 
808 aa  214  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.54 
 
 
773 aa  211  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  33.57 
 
 
494 aa  210  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.81 
 
 
759 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.88 
 
 
837 aa  205  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 
809 aa  203  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.75 
 
 
773 aa  201  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.65 
 
 
814 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.91 
 
 
761 aa  198  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.28 
 
 
868 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 
771 aa  193  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.62 
 
 
773 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.62 
 
 
773 aa  190  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  27.86 
 
 
872 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 
750 aa  189  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.38 
 
 
654 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.95 
 
 
770 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.64 
 
 
773 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  28.23 
 
 
773 aa  181  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27 
 
 
772 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27 
 
 
772 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.87 
 
 
749 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.09 
 
 
773 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 
811 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 
682 aa  170  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.03 
 
 
766 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 
835 aa  157  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
281 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.33 
 
 
797 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  25.63 
 
 
735 aa  154  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.77 
 
 
840 aa  153  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  25.33 
 
 
735 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.93 
 
 
846 aa  152  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 
283 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  35.96 
 
 
348 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
286 aa  148  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  25.21 
 
 
847 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  29.53 
 
 
503 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  26.96 
 
 
493 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
839 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  26.69 
 
 
747 aa  146  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.32 
 
 
772 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.18 
 
 
785 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  35.36 
 
 
461 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.93 
 
 
851 aa  145  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.82 
 
 
745 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.94 
 
 
802 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  35.09 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 
421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  27.54 
 
 
819 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  34.22 
 
 
461 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  35.09 
 
 
461 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  35.09 
 
 
461 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 
320 aa  141  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  32.3 
 
 
284 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
406 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.39 
 
 
815 aa  140  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.43 
 
 
781 aa  140  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 
790 aa  140  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  31.27 
 
 
291 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.91 
 
 
840 aa  138  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  31.89 
 
 
292 aa  138  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
294 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.31 
 
 
770 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  26.48 
 
 
787 aa  135  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.24 
 
 
740 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.15 
 
 
839 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  27.97 
 
 
469 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.45 
 
 
801 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.7 
 
 
841 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
451 aa  133  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  31.35 
 
 
336 aa  132  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  33.96 
 
 
300 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.01 
 
 
801 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  33.96 
 
 
300 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  31.23 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  24.58 
 
 
900 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  27.63 
 
 
604 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
798 aa  129  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25 
 
 
746 aa  129  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.27 
 
 
778 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 
300 aa  128  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
352 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.55 
 
 
722 aa  127  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>