More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0519 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  76.34 
 
 		 186 aa  300  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  72.58 
 
 		 186 aa  286  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  71.74 
 
 		 184 aa  284  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  58.15 
 
 		 184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  58.15 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  59.24 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  58.7 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 185 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  60.22 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 185 aa  220  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  56.45 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  57.63 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  55.19 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  56.82 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  57.47 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  52.69 
 
 		 186 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  52.69 
 
 		 186 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  52.69 
 
 		 186 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  55.11 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 186 aa  207  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  207  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 173 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  53.41 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  54.4 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  53.55 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  57.63 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  54.8 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 189 aa  203  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  57.47 
 
 		 174 aa  204  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  55 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  51.08 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 184 aa  201  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  55 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>