More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0044 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  62.78 
 
 
1204 aa  1538  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  60.22 
 
 
1188 aa  1473  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
1183 aa  2452  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.92 
 
 
1187 aa  1560  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  47.13 
 
 
1197 aa  1095  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  50.17 
 
 
1183 aa  1202  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.36 
 
 
1218 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 
1202 aa  599  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  33.95 
 
 
1218 aa  596  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 
1221 aa  595  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  33.81 
 
 
1210 aa  586  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  34.6 
 
 
1217 aa  588  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  34.25 
 
 
1212 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  33.93 
 
 
1213 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  34.08 
 
 
1212 aa  576  1e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  32.75 
 
 
1214 aa  575  1e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.78 
 
 
1227 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 
1282 aa  525  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  31.75 
 
 
1259 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 
1280 aa  508  1e-142  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.81 
 
 
1289 aa  506  1e-142  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  30.1 
 
 
1271 aa  505  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  31.04 
 
 
1300 aa  494  1e-138  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 
1288 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  30.22 
 
 
1292 aa  492  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 
1307 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 
1304 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 
1307 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
1304 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.69 
 
 
1309 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 
1292 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  30.31 
 
 
1291 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  29.56 
 
 
1279 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
1279 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  29.71 
 
 
1307 aa  476  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 
1265 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  31.24 
 
 
1308 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  29.1 
 
 
1359 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.87 
 
 
1277 aa  442  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  28.87 
 
 
1277 aa  442  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 
1292 aa  443  1e-122  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  35.26 
 
 
1341 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.26 
 
 
1341 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.26 
 
 
1341 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  35.26 
 
 
1341 aa  268  6e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.88 
 
 
1286 aa  267  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  30.46 
 
 
1308 aa  266  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  28.23 
 
 
1324 aa  266  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  34.13 
 
 
1342 aa  266  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  33.95 
 
 
1342 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  33.95 
 
 
1342 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  33.95 
 
 
1342 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  33.95 
 
 
1342 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  33.95 
 
 
1342 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  33.95 
 
 
1342 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  35.87 
 
 
1349 aa  265  5e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  35.87 
 
 
1364 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 
1340 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.08 
 
 
1344 aa  263  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 
1340 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  35.9 
 
 
1324 aa  258  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.72 
 
 
1371 aa  258  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 
1345 aa  256  2e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 
1345 aa  256  2e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  29.36 
 
 
1345 aa  252  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  32.02 
 
 
459 aa  167  1e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  31.79 
 
 
459 aa  165  4e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.76973e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  30.05 
 
 
461 aa  157  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.23644e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  28.07 
 
 
459 aa  156  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03504e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.96 
 
 
459 aa  155  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 
466 aa  154  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.16 
 
 
461 aa  138  6e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.09 
 
 
459 aa  136  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  26.87 
 
 
457 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 
459 aa  134  8e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.36 
 
 
479 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.31 
 
 
459 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  26.8 
 
 
472 aa  130  2e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.2 
 
 
475 aa  129  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  26.75 
 
 
490 aa  128  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.18 
 
 
459 aa  128  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.05 
 
 
460 aa  128  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  26.43 
 
 
481 aa  128  8e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  26.27 
 
 
483 aa  128  8e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  26.93 
 
 
462 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.49 
 
 
486 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.62 
 
 
498 aa  126  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  26.7 
 
 
462 aa  127  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.38 
 
 
461 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.05 
 
 
464 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  26.28 
 
 
497 aa  126  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.62 
 
 
498 aa  125  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.37 
 
 
498 aa  125  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.94 
 
 
469 aa  125  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27.88 
 
 
466 aa  125  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.82 
 
 
459 aa  122  4e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  35.75 
 
 
483 aa  122  4e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.76 
 
 
494 aa  122  5e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  34.24 
 
 
497 aa  122  5e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 
500 aa  122  5e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>