More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1203 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  100 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.44 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  39.22 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  39.22 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  39.07 
 
 		 317 aa  225  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  39.53 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.85 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.74 
 
 		 427 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.16 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  36.09 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  36.81 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  36.22 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  36.67 
 
 		 311 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  36.67 
 
 		 311 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  34.85 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  34.85 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  34.53 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  34.85 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  36.3 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  34.85 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  34.75 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  34.75 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  34.75 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  34.53 
 
 		 318 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  35 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  34.2 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  34.2 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.55 
 
 		 407 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  34.55 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  37.09 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  33.98 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  35.86 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  36.57 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  38.78 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  38.24 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  36.07 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  36.09 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  38.96 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.29 
 
 		 556 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  35.64 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  36.75 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  37.03 
 
 		 458 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  38.39 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  36.57 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  34.1 
 
 		 409 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.42 
 
 		 579 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  32.91 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  37.3 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.71 
 
 		 555 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  34.11 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  36.71 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  35.02 
 
 		 460 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  35.05 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  35.33 
 
 		 396 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.83 
 
 		 394 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  34.75 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  34.64 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  35.71 
 
 		 555 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  34.64 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  36.68 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  36.51 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  35.02 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  36.68 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  36.08 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  31.07 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  37.83 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  36.08 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  36.08 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  34.59 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  34.71 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  32.28 
 
 		 340 aa  175  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  34.7 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  35.44 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  33.33 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  37.38 
 
 		 550 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  33.96 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  35.44 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  35.44 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  35.71 
 
 		 547 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  35.44 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  34.92 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  36.6 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  32.48 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  34.65 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  35.71 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  33.54 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  37.29 
 
 		 316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  36.71 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  33.54 
 
 		 317 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>