96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1549 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
139 aa  281  2e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  61.6 
 
 
140 aa  154  5e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  63.33 
 
 
140 aa  151  3e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  51.7 
 
 
178 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  51.7 
 
 
178 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  54.62 
 
 
138 aa  117  4e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2956  flagellar biosynthesis protein FliO  56.49 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  44.07 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  44.07 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  44.07 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  44.07 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  44.07 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  49.44 
 
 
186 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  42.74 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  40.87 
 
 
140 aa  80.5  8e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  44.57 
 
 
224 aa  80.1  9e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.13 
 
 
149 aa  80.1  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  35.71 
 
 
186 aa  79  2e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  45.56 
 
 
191 aa  77.8  4e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.37 
 
 
187 aa  77  7e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.82 
 
 
221 aa  76.3  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  40.62 
 
 
164 aa  76.6  1e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  40.82 
 
 
211 aa  75.9  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.91 
 
 
188 aa  75.5  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.82 
 
 
221 aa  75.9  2e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  40.82 
 
 
221 aa  75.9  2e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  40.82 
 
 
221 aa  75.9  2e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  40.82 
 
 
211 aa  75.9  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  44.94 
 
 
180 aa  73.6  9e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  39.05 
 
 
130 aa  73.2  1e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  44.32 
 
 
193 aa  71.6  3e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  44.32 
 
 
193 aa  71.6  3e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.43 
 
 
136 aa  70.9  5e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  37.89 
 
 
208 aa  71.2  5e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  41.76 
 
 
112 aa  68.9  2e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  39.58 
 
 
206 aa  69.3  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  34.91 
 
 
203 aa  69.3  2e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.71 
 
 
142 aa  68.2  4e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  38.54 
 
 
127 aa  67.4  5e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  38.54 
 
 
127 aa  67.4  5e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  33.11 
 
 
159 aa  67  9e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.47 
 
 
163 aa  66.2  1e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.24 
 
 
125 aa  64.7  4e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1237  flagellar biosynthesis protein FliO  45.05 
 
 
121 aa  62.4  2e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0462666  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  36.19 
 
 
150 aa  61.6  3e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.84 
 
 
149 aa  62  3e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  35.85 
 
 
151 aa  61.6  3e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4177  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 
162 aa  61.2  5e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  37.97 
 
 
124 aa  57.8  5e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.24 
 
 
125 aa  56.6  1e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  32.38 
 
 
144 aa  56.2  1e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  43.24 
 
 
146 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.61 
 
 
145 aa  56.2  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  32.99 
 
 
127 aa  55.5  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  35.87 
 
 
137 aa  55.8  2e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.09 
 
 
166 aa  54.3  5e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  30.93 
 
 
151 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1695  flagellar biosynthesis protein FliO  43.96 
 
 
121 aa  54.3  6e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18935  normal  0.0258842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2047  flagellar biosynthesis protein FliO  43.96 
 
 
121 aa  54.3  6e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1701  flagellar biosynthesis protein FliO  43.96 
 
 
121 aa  54.3  6e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1609  flagellar biogenesis protein FliO  35.65 
 
 
144 aa  53.9  8e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796817  normal  0.163037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2724  flagellar biosynthesis protein FliO  43.96 
 
 
101 aa  53.9  8e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0658443  normal  0.30284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.51 
 
 
153 aa  53.5  1e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  43.06 
 
 
114 aa  53.1  1e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  33.33 
 
 
120 aa  52  3e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.58 
 
 
136 aa  51.6  3e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  36.56 
 
 
140 aa  52  3e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  37.97 
 
 
120 aa  52  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  31.78 
 
 
137 aa  51.6  3e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1068  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 
121 aa  51.6  4e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.4308e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06194  flagellar protein  45.9 
 
 
138 aa  50.8  7e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00972  flagellar protein  45.9 
 
 
138 aa  50.8  7e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0238989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  29.79 
 
 
144 aa  50.1  1e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2180  flagellar biosynthesis protein FliO  41.76 
 
 
121 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.96305e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.06 
 
 
163 aa  49.3  2e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  45.9 
 
 
139 aa  49.3  2e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  31.25 
 
 
150 aa  49.3  2e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  37.84 
 
 
146 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.79 
 
 
144 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.77 
 
 
121 aa  48.1  4e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.29 
 
 
143 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  31.43 
 
 
209 aa  47  8e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.73 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  41.33 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  28.35 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1354  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.78 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  31 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2977  flagellar biosynthesis protein FliO  31.63 
 
 
180 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.35 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1706  flagellar protein FliO  36.25 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  26.83 
 
 
129 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0559  hypothetical protein  52.38 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  34.62 
 
 
141 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  34.62 
 
 
140 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>