86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1335 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  100 
 
 		 133 aa  259  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  72.82 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  58.1 
 
 		 125 aa  136  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  60.58 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  53.23 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  54.05 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  57.36 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  50 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  55.34 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  55.34 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1291  flagellar biosynthesis protein, FliO  49.62 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  55.34 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  55.34 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1358  flagellar biosynthesis protein, FliO  55.34 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  48.12 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  55.34 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  44.58 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  40.82 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  40.82 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  40.82 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  40.82 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.71 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  40.82 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  37.08 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.96 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  34.78 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.19 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  32.99 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  33.7 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  32.48 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  31.25 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  30.85 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.25 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  36.62 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  36.89 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  36 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  29.9 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.65 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  25.44 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  31.63 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  32.14 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  30.43 
 
 		 203 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  38.55 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.75 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  29.17 
 
 		 120 aa  50.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  33.66 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.16 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  31.87 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  32.94 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  32.94 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  30 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  26.45 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3439  hypothetical protein  30.21 
 
 		 141 aa  47.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  36.79 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  30.59 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  28.46 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.25 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  32.67 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  40 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1706  flagellar protein FliO  35.54 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  31.71 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  28.99 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  28.99 
 
 		 221 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  28.99 
 
 		 221 aa  43.9  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  28.99 
 
 		 221 aa  43.9  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  22.55 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  28.99 
 
 		 211 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  28.99 
 
 		 211 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  28.99 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.09 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  27.08 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.27 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  27.54 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.09 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  26.09 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  29.17 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.09 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3291  hypothetical protein  33.05 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.55 
 
 		 163 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1237  flagellar biosynthesis protein FliO  40.62 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0462666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  30.49 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.49 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3584  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  26.09 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.621138  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  28.57 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4200  hypothetical protein  28.26 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>