82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2173 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  100 
 
 		 159 aa  322  9e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.04 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  43.06 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.78 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  35.96 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  31.11 
 
 		 208 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.36 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  41.1 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  27.27 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.77 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  33.04 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  33.04 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  33.04 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  33.04 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  33.04 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  35.48 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  32.38 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  34.45 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.45 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.35 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.94 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  44.83 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.04 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  32.9 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  32.58 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  29.41 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  29.41 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  29.41 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  32.58 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  33.68 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  29.41 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  28.68 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  27.14 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  31.93 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  30.26 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  28.85 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  25.98 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00972  flagellar protein  41.07 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0238989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06194  flagellar protein  41.07 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.14 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.01 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4177  flagellar biosynthesis protein FliO  40.2 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  32.43 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.55 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.18 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.18 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  32.18 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  35.38 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.63 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.94 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  28.44 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  34.04 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  33.01 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  26.92 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  28.21 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  29.35 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.49 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.73 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  28.77 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  28.57 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  25.96 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.31 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  30.47 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.33 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  29.17 
 
 		 130 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  38.3 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.43 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  27.94 
 
 		 136 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  27.94 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2977  flagellar biosynthesis protein FliO  27.36 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.67 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  33.58 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  33.58 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1609  flagellar biogenesis protein FliO  38.64 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796817  normal  0.163037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  33.93 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  30.26 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1237  flagellar biosynthesis protein FliO  30.39 
 
 		 121 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0462666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1354  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.04 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>