16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0559 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0559  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  204  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  63.1 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  63.1 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  48.57 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  52.58 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0647  flagellar biosynthesis protein FliO  46.67 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  47.3 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  44.19 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  46.3 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  44.44 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  45.83 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  44.3 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  44.3 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.67 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  52.38 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  40 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>