55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1025 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  64.56 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0647  flagellar biosynthesis protein FliO  45.98 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.13 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0559  hypothetical protein  44.19 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  45 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  45 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.45 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  45.61 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.19 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  38.64 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  35.16 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  39.83 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  37.04 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  41.86 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  41.86 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  41.86 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  41.86 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  41.86 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  37.5 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.71 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.66 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  30.7 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  34.88 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  41.27 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  41.27 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  37.23 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.18 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.18 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  34.18 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  40 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  31.25 
 
 		 209 aa  42.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  46.94 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.25 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.41 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.51 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  35.06 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  29.73 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.18 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  38.96 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  30.11 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  38.96 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  30.11 
 
 		 221 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3584  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  30.21 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.621138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  30.69 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  30.11 
 
 		 221 aa  42  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  30.11 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  37.18 
 
 		 127 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  30.11 
 
 		 221 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  30.11 
 
 		 211 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.49 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  34.94 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  29.03 
 
 		 211 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.25 
 
 		 162 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>