More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1183 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 
258 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  29.43 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  35.32 
 
 
305 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  28.73 
 
 
287 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  28.01 
 
 
285 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.74 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  26.94 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  30.86 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  31.72 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  27.17 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  27.59 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  27.53 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  27.31 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  27.47 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  36.59 
 
 
284 aa  95.5  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  29.24 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  26.94 
 
 
271 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  27.88 
 
 
307 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  35.03 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  26.94 
 
 
610 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0931  putative rhodanese-like sulfur transferase  29.41 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186948  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  26.2 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  25.09 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  25.54 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.77 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  32.16 
 
 
375 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.74 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  28.14 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.49 
 
 
284 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  28.14 
 
 
277 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  26.2 
 
 
613 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  26.86 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  30.61 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.35 
 
 
284 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  35.26 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  27.55 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  27.55 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  27.55 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  26.57 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  31.55 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  29.15 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  32.63 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  27.55 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.43 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  29.59 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  29.47 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  29.14 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  32.66 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  31.28 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  28.64 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  34.76 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.01 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  34.76 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  27.97 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  26.1 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  30.58 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  32.31 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.45 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  29.07 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  32.87 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  30.2 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.31 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  25.37 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  32.84 
 
 
280 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
291 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  35.75 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  32.87 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.67 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  30.63 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  27.8 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  29.67 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.3 
 
 
627 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.59 
 
 
805 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  33.5 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  25.65 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  30.48 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  33.17 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.07 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  28.71 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.27 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  30.9 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  34.36 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  25.93 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  29.5 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  28.5 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.96 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  27.18 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>