More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3058 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  75 
 
 
593 aa  867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3040  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.73 
 
 
607 aa  856    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.636426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  74.83 
 
 
593 aa  865    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  84.85 
 
 
594 aa  971    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3221  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.56 
 
 
607 aa  855    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.54 
 
 
593 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.71 
 
 
593 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.23 
 
 
592 aa  903    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.54 
 
 
593 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.83 
 
 
593 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.66 
 
 
593 aa  862    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.83 
 
 
593 aa  865    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  77.68 
 
 
591 aa  919    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.54 
 
 
593 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  75 
 
 
593 aa  867    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3079  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.56 
 
 
607 aa  855    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.83 
 
 
593 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.32 
 
 
601 aa  929    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75 
 
 
593 aa  867    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.54 
 
 
593 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  73.88 
 
 
593 aa  868    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 
597 aa  1209    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  48.89 
 
 
592 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  48.95 
 
 
591 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  41.27 
 
 
606 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  40.21 
 
 
592 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  39.21 
 
 
587 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  38.79 
 
 
594 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  38.61 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.78 
 
 
587 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  38.96 
 
 
587 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
587 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
587 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.96 
 
 
587 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.96 
 
 
587 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  38.61 
 
 
587 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.78 
 
 
587 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  38.68 
 
 
587 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.01 
 
 
579 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.05 
 
 
581 aa  369  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  39.72 
 
 
677 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.77 
 
 
666 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.58 
 
 
666 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.77 
 
 
666 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.58 
 
 
666 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.22 
 
 
666 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.03 
 
 
666 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.58 
 
 
666 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 
666 aa  339  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.09 
 
 
597 aa  339  7e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.68 
 
 
600 aa  336  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  36.19 
 
 
666 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.74 
 
 
592 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  34.25 
 
 
602 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  32.23 
 
 
622 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  32.94 
 
 
578 aa  320  6e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  31.25 
 
 
599 aa  319  7e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.15 
 
 
599 aa  313  4.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.83 
 
 
604 aa  313  6.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.01 
 
 
594 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.08 
 
 
611 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  35.33 
 
 
650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  34.65 
 
 
592 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  34.91 
 
 
610 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  32.53 
 
 
625 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.31 
 
 
598 aa  296  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  29.3 
 
 
607 aa  296  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  32.49 
 
 
685 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.55 
 
 
597 aa  294  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  31.29 
 
 
680 aa  294  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  32.31 
 
 
588 aa  293  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  33.59 
 
 
691 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.26 
 
 
597 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.17 
 
 
597 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.17 
 
 
597 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.7 
 
 
617 aa  290  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  31.22 
 
 
594 aa  290  6e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.56 
 
 
677 aa  290  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  33.96 
 
 
613 aa  289  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  31.93 
 
 
603 aa  289  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  32.34 
 
 
645 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  31.64 
 
 
602 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.01 
 
 
609 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 
598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  34.63 
 
 
634 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  31.1 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.43 
 
 
598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.52 
 
 
600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  31.13 
 
 
627 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  30.72 
 
 
579 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.4 
 
 
614 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  30.72 
 
 
579 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  34.4 
 
 
733 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 
602 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
589 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  31.18 
 
 
589 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  33.65 
 
 
663 aa  280  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.91 
 
 
669 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  29.29 
 
 
591 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.31 
 
 
598 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>