More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2330 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  81.07 
 
 
413 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  79.4 
 
 
434 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  80.56 
 
 
434 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  79.86 
 
 
434 aa  709    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
436 aa  886    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  79.63 
 
 
434 aa  710    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  80.56 
 
 
434 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 
443 aa  707    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  83.33 
 
 
442 aa  726    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  79.86 
 
 
434 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  79.63 
 
 
434 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  83.91 
 
 
442 aa  731    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  80.09 
 
 
434 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 
443 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  80.32 
 
 
434 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 
443 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  79.63 
 
 
434 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  80.09 
 
 
434 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  88.3 
 
 
436 aa  754    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  80.96 
 
 
435 aa  720    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  79.63 
 
 
434 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  79.17 
 
 
434 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  65.88 
 
 
436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  65.88 
 
 
430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  62.67 
 
 
437 aa  571  1.0000000000000001e-162  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  65.09 
 
 
431 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  63.55 
 
 
431 aa  557  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  59.58 
 
 
435 aa  521  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  59.03 
 
 
435 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  58.22 
 
 
428 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  58.63 
 
 
428 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  56.18 
 
 
439 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  58.16 
 
 
428 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  55.14 
 
 
433 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 
443 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  56.88 
 
 
438 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  55.22 
 
 
434 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  56.31 
 
 
438 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  55.66 
 
 
433 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  55.97 
 
 
429 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  55.89 
 
 
433 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  55.15 
 
 
438 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 
433 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  55.66 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  53.5 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  55.43 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 
433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  55.43 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 
433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  54.08 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  54.93 
 
 
426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
429 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
427 aa  421  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
431 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  52.38 
 
 
429 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 
422 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  51.07 
 
 
429 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  50.95 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  53.16 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  51.87 
 
 
431 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  48.83 
 
 
439 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  46.5 
 
 
429 aa  395  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  47.9 
 
 
867 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 
430 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  46.91 
 
 
852 aa  372  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 
431 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  45.96 
 
 
431 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  47.18 
 
 
867 aa  365  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  44.66 
 
 
433 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  44.15 
 
 
433 aa  348  9e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  42.42 
 
 
426 aa  342  7e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  41.55 
 
 
424 aa  339  7e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  44.22 
 
 
416 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  42.46 
 
 
442 aa  329  7e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  44.67 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  44.64 
 
 
403 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  42.18 
 
 
427 aa  323  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  43.88 
 
 
416 aa  320  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  41.06 
 
 
426 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  44.88 
 
 
436 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  41.06 
 
 
434 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  43.14 
 
 
436 aa  316  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  45.74 
 
 
430 aa  316  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  40.84 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 
429 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0450  histidinol dehydrogenase  44.64 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.722983  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 
425 aa  312  9e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  42.95 
 
 
434 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  40.45 
 
 
424 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  38.41 
 
 
428 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  39.86 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  41.21 
 
 
424 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  42.01 
 
 
428 aa  309  5e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  43.41 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  39.37 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  39.14 
 
 
429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>