More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2760 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2760  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 127 aa  256  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000679663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  62.6 
 
 		 126 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  60.98 
 
 		 126 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  60.98 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  60.98 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2051  30S ribosomal protein S8  51.18 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00264712  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  53.73 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.15 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  51.56 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  50 
 
 		 131 aa  129  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0861  SSU ribosomal protein S8P  50.76 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118067  hitchhiker  0.00176948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1970  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00042719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1219  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1729  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0375  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1182  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  48.48 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  51.56 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  46.32 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  47.66 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  47.33 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  47.66 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  48.03 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  47.33 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  48.44 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  46.21 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  48.44 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  46.46 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  47.62 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  48.48 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  46.21 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1781  SSU ribosomal protein S8P  49.62 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0284489  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  47.73 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  42.31 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  47.37 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>