210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0513 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 130 aa  266  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  76.74 
 
 		 134 aa  200  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  72.87 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 130 aa  186  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  65.08 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  65.91 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  63.36 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  59.7 
 
 		 133 aa  167  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 132 aa  166  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  60.63 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  58.91 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  61.36 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  56.15 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  40.37 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  33.62 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  36.19 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  33.06 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  34.35 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  40.91 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  34.58 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  31.9 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  30.89 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  33.9 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  31.82 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  31.82 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  32 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  32.82 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  32.82 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  32 
 
 		 197 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  32.2 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  32.8 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  31.2 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  36.51 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  34.62 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  31.9 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  29.6 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  34.68 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  33.05 
 
 		 185 aa  63.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  29.27 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  33.07 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  31.54 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  29.27 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  30.3 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  35.19 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  29.03 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  46.48 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  30.66 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  34.59 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  33.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  30.66 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  30.09 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  36.36 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  30.3 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  31.2 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  29.06 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  31.25 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  26.23 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  32.69 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>