79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3858 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  72.22 
 
 		 173 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  48 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  47.95 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  49.09 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  48.77 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  44.17 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  48.77 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  48.77 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  48.77 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  48.77 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  48.77 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  42.11 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.5 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  46.33 
 
 		 180 aa  144  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  40.94 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  39.77 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.37 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.7 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  42.77 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  36.22 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  43.31 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  38.65 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  38.65 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  38.65 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  38.65 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  38.65 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  38.65 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.36 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.1 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  36.54 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  38.04 
 
 		 193 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.75 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  43.23 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.82 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.82 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.82 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  37.82 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  43.23 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.79 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.47 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  40.26 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  40.26 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  40.26 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  39.61 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  35.22 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.22 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  35.22 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.13 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  30.3 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  30.3 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  30.72 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  30.72 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  30.72 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.72 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  30.72 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.29 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  31.1 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.72 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  31.48 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  31.48 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  31.48 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  31.48 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  31.48 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  31.48 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  32.73 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  22.9 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  32.35 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  31.68 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.13 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  31.25 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.63 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  27.08 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  27.68 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  27.54 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  28.24 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  25.64 
 
 		 160 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>