76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0976 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  88.95 
 
 
188 aa  342  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  77.89 
 
 
185 aa  300  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  66.67 
 
 
183 aa  254  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  68.6 
 
 
193 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  68.6 
 
 
193 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  68.02 
 
 
193 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  68.02 
 
 
193 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  68.02 
 
 
193 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  68.02 
 
 
193 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  68.02 
 
 
193 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  65.87 
 
 
176 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  64.29 
 
 
178 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  57.8 
 
 
173 aa  207  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  47.47 
 
 
173 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  47.88 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.25 
 
 
164 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  46.25 
 
 
164 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.25 
 
 
164 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.25 
 
 
164 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  46.06 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  46.06 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  46.06 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  45.45 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  40.49 
 
 
173 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.22 
 
 
184 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  43.5 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  42.51 
 
 
186 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.35 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  41.92 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  37.01 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  42.24 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  42.24 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.58 
 
 
191 aa  110  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  38.99 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.06 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  35.06 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  35.06 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  39.38 
 
 
169 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  39.38 
 
 
169 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  39.39 
 
 
180 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.22 
 
 
184 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  33.54 
 
 
167 aa  84.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  31.08 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  29.94 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  28.04 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.04 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.65 
 
 
161 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  28.04 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  27.06 
 
 
161 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.92 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  27.49 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  27.49 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  27.49 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  27.49 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.9 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  27.49 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  27.49 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  26.74 
 
 
161 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  26.74 
 
 
161 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  28.4 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.22 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  26.74 
 
 
161 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.74 
 
 
161 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  27.52 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.11 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  27.52 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  32.32 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  25.71 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  29.52 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>