77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0307 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 
164 aa  336  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  98.78 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  98.78 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  98.17 
 
 
164 aa  331  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  55.26 
 
 
178 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  50.64 
 
 
173 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  49.02 
 
 
185 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  48.12 
 
 
183 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  48.73 
 
 
188 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  47.1 
 
 
193 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  47.1 
 
 
193 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  47.1 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  47.1 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  47.1 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  47.1 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  46.25 
 
 
190 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  46.45 
 
 
193 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.75 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  44.44 
 
 
173 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.75 
 
 
171 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  40.52 
 
 
173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  44.81 
 
 
172 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  43.79 
 
 
172 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  43.79 
 
 
172 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  43.79 
 
 
172 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.82 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.77 
 
 
184 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  35.03 
 
 
191 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  40.52 
 
 
180 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  36.42 
 
 
167 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.18 
 
 
175 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.77 
 
 
191 aa  98.6  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  37.27 
 
 
182 aa  97.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  37.27 
 
 
186 aa  97.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  36.02 
 
 
182 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  36.02 
 
 
178 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  36.02 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  36.02 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  36.02 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  36.02 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  36.02 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.26 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  38.26 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  38.26 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  36.02 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  32.92 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  36.02 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  31.82 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  31.82 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.82 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  31.72 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.59 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.59 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  31.85 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  33.59 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.03 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.31 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  32.59 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.37 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  27.15 
 
 
248 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.74 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  26.81 
 
 
235 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  26.81 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  30.69 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.63 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  25.93 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>