79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3562 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  330  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  330  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  330  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 
161 aa  330  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  97.5 
 
 
161 aa  322  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  96.88 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  96.88 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  91.88 
 
 
160 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  90.62 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  90.62 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  90.62 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  90.62 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  90.62 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  90.62 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  93.63 
 
 
159 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  70.06 
 
 
157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  56.69 
 
 
162 aa  185  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  58.33 
 
 
159 aa  184  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  37.59 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  35.81 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  34.44 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  33.85 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  33.85 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.08 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.54 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  31.3 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  35.29 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  28.67 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  31.01 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  38.69 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  37.96 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.28 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  31.01 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.5 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  33.1 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.72 
 
 
184 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  29.56 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  34.01 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  34.27 
 
 
180 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.37 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.2 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  28.12 
 
 
173 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.31 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.59 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  33.58 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.58 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.67 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.93 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.08 
 
 
171 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.13 
 
 
183 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.37 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  26.67 
 
 
235 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  26.67 
 
 
235 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  31.37 
 
 
191 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  34.23 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.28 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  31.54 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  35.07 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  35.07 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  35.07 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.94 
 
 
173 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  26.74 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  31.25 
 
 
248 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.47 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  31.37 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  26 
 
 
141 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  32.84 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.86 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.93 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.36 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  30.43 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  29.91 
 
 
150 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  26.22 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  26.22 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  33.1 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  33.1 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.1 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  28.7 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>