73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2452 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  63.04 
 
 		 191 aa  250  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.63 
 
 		 175 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  47.34 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  42.11 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  42.59 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  43.82 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  43.68 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  39.38 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  43.02 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  43.9 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.88 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.58 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.73 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  41.14 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  40.49 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  38.65 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.84 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  35.58 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  35.67 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.22 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  35.98 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.44 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.42 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  34.42 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.42 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.77 
 
 		 164 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.5 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  38.62 
 
 		 172 aa  84.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.57 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  31.21 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  31.21 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  26.71 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  26.71 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.71 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  28.97 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  27.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  23.84 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  27.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.91 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  31.19 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  27.72 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.28 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.36 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  29.36 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  29.36 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  29.36 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  29.36 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.36 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  29.7 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  33.03 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>