62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0760 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.03 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  33.03 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.03 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.82 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0792  hypothetical protein  31.11 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0746  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1041  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0703  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2015  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2077  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0441  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1898  hypothetical protein  28.89 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.3 
 
 
183 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  29.37 
 
 
176 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  25.66 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  31.25 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.33 
 
 
188 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  29.75 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.58 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  28.04 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  29.73 
 
 
235 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.66 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  29.73 
 
 
235 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.63 
 
 
184 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  30.59 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  28.16 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.29 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  30.59 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  30.59 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.2 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.18 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  38.18 
 
 
248 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.88 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  27.56 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  29.81 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.57 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  32 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  28.35 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.85 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  27.45 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  27.45 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.12 
 
 
182 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>