93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3663 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  57.85 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  59.43 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  56.61 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  55.33 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  57.28 
 
 		 216 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  54.38 
 
 		 214 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  51.38 
 
 		 214 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  48.97 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  53.24 
 
 		 211 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  53.24 
 
 		 211 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  53.24 
 
 		 211 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  48.76 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  47.06 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  48.87 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  47.33 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  45.7 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  45.25 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  45.25 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  44.05 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  45.25 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  48.9 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  41.41 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  42.41 
 
 		 217 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  47.09 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  35.36 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.42 
 
 		 209 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  30.09 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  35.56 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  39.58 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  37.1 
 
 		 207 aa  89.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  39.31 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  39.31 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  39.31 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  39.31 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  40.14 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  39.31 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  30.43 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  39.01 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  38.41 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  34.34 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  37.78 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  31.35 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  34.74 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  30.51 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  27.93 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  36.42 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  34 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  28.77 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  28.77 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  29.44 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  39.1 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  38.21 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  28.12 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  26.55 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  28.8 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  27.36 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  26.17 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  23.71 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  24.87 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  25.13 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  24.6 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  24.46 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  24.06 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  28.35 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  24.74 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  26.95 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  26.72 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  31.54 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  30.22 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  23.24 
 
 		 305 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  23.76 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  24.05 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  22.31 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  22.68 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 901 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  23.53 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 222 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>