More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0013 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  100 
 
 
154 aa  320  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  82.24 
 
 
156 aa  259  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2979  dehydratase  79.61 
 
 
170 aa  249  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495865  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0972  dehydratase  49.66 
 
 
184 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  32.89 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  34.46 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  30.87 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  34.11 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.25 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  31.03 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  32.88 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  32.33 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  29.61 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  28.77 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  32.33 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
684 aa  64.7  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.12 
 
 
686 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.47 
 
 
464 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  30.26 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.77 
 
 
679 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0206  hypothetical protein  32.43 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603471  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
684 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
684 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  32.58 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  28.1 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  31.29 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  26.52 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1790  maoC family protein  32.54 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1929  MaoC family protein  32.54 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.988718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
695 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  32.64 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1747  acyl dehydratase  32.28 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  28.19 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1965  maoC family protein  31.5 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000123748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  31.25 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  27.4 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  26.14 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  26.14 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  26.14 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.67 
 
 
472 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.5 
 
 
471 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  26.14 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
684 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.11 
 
 
690 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  29.2 
 
 
472 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
683 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  27.52 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  30.41 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3559  hypothetical protein  29.22 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  41.67 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  26.17 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.07 
 
 
470 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  32.79 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  27.21 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  33.59 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  26.85 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.67 
 
 
472 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  27.4 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  27.4 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.21 
 
 
686 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
681 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.88 
 
 
681 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  27.78 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
681 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  26.75 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  27.74 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1955  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.03 
 
 
472 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435715  normal  0.221917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  33.59 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  37.04 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  30.3 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  32.82 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  33.11 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.23 
 
 
500 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.87 
 
 
681 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6428  MaoC-like dehydratase  30.51 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.632937  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  24.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2974  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.87 
 
 
473 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
682 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  36.75 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  30.91 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.07 
 
 
683 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  28.79 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  28 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4072  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00371629  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.26 
 
 
690 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  28.37 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  32.19 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  32.19 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  32.19 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  32.19 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  32.19 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0052  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.87 
 
 
468 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70674  normal  0.03837 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  32.19 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  32.19 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  29.32 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.32 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  29.32 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  29.32 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>