More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2371 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
308 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2371  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
308 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000177562  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
335 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.920861  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
314 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.467345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2096  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.16 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644928  hitchhiker  0.0000124933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
314 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
312 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0747  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
311 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
314 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  32.37 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1219  GDP-L-fucose synthase  29.75 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
331 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  30.16 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
320 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
316 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
316 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.75 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  31.02 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
310 aa  113  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 
322 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
314 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
329 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
316 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73165  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
321 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1180  GDP-L-fucose synthetase  29.47 
 
 
321 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26810  predicted protein  26.92 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.032198  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  29.97 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  28.22 
 
 
320 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2345  GDP-L-fucose synthetase  29.15 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1010  GDP-L-fucose synthetase  29.15 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.238091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2987  GDP-L-fucose synthetase  29.15 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01958  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/ GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  28.84 
 
 
321 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
321 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.171954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01947  hypothetical protein  28.84 
 
 
321 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  30.59 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1828  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1313  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
308 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000361495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  29.97 
 
 
316 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
321 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
333 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
313 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2116  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  28.93 
 
 
319 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
331 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307178  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2341  GDP-L-fucose synthetase  29.19 
 
 
321 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
306 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2448  GDP-L-fucose synthetase  29.19 
 
 
321 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2233  GDP-L-fucose synthetase  29.28 
 
 
321 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.487603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
324 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
312 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2290  GDP-L-fucose synthetase  28.97 
 
 
321 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
316 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
318 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5859  bifunctional GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  30.42 
 
 
333 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
312 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
313 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
314 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
310 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
309 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
321 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2334  GDP-L-fucose synthetase  28.88 
 
 
321 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11546  nucleotide-sugar epimerase epiA  27.92 
 
 
322 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1775  GDP-L-fucose synthetase  30.3 
 
 
327 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
321 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  27.22 
 
 
321 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
322 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
345 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1235  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
320 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0771  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase and GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  28.12 
 
 
322 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0418  fucose synthetase family protein  27.4 
 
 
326 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0709177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
317 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
326 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  27.22 
 
 
321 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0361  fucose synthetase family protein  27.4 
 
 
326 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0252323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
310 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
321 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2967  GDP-L-fucose synthetase  29.11 
 
 
321 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
312 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
321 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1282  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
320 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
319 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00831994  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
313 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
337 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
356 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  0.526104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
324 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>