More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2121 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
112 aa  233  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  58.1 
 
 
111 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  59.43 
 
 
109 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0912  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
111 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  54.63 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  52.29 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  51.38 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  45 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  40.57 
 
 
108 aa  107  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  42.45 
 
 
111 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  43.88 
 
 
108 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  42.42 
 
 
108 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  39.22 
 
 
107 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  41 
 
 
107 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  38.32 
 
 
107 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  40.91 
 
 
108 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  41.9 
 
 
106 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  38.32 
 
 
107 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  39.22 
 
 
107 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  36.79 
 
 
108 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  44.55 
 
 
111 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  41.35 
 
 
150 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  36.79 
 
 
108 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  39.6 
 
 
109 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  36.45 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  39.09 
 
 
112 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  36.45 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  37.38 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  40.59 
 
 
133 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  37.38 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.45 
 
 
148 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  37.38 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  35.85 
 
 
108 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  38.68 
 
 
108 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  37.38 
 
 
107 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  38.68 
 
 
109 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  38.68 
 
 
108 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  38.68 
 
 
108 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  38.68 
 
 
108 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  41.75 
 
 
109 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  42 
 
 
106 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  45.71 
 
 
109 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  41.9 
 
 
238 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  40.21 
 
 
107 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  43.4 
 
 
108 aa  100  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  40.95 
 
 
106 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  44.68 
 
 
106 aa  100  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  37.86 
 
 
110 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  37.62 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  39.25 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  38.68 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  36.63 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  37.74 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  38.24 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  41.67 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  41.75 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  38.68 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  37.5 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  40.59 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  39.6 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  39.81 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  37.74 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  36.45 
 
 
107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  36.45 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  37.38 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  38.61 
 
 
146 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  38.61 
 
 
146 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  40.59 
 
 
110 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  40 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  40.57 
 
 
107 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  38.83 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  38.68 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  37.74 
 
 
112 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.27 
 
 
106 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>