More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0439 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  80 
 
 		 130 aa  202  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 		 120 aa  197  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  77.5 
 
 		 120 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  77.5 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  77.12 
 
 		 159 aa  189  9e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  77.5 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  77.5 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  76.27 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  75.21 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  74.58 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  73.73 
 
 		 158 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  72.44 
 
 		 127 aa  179  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 162 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 		 162 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  73.28 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  55.86 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  50 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  54.13 
 
 		 113 aa  124  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 114 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  51.35 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>