267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2571 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  51.81 
 
 		 160 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  46.78 
 
 		 170 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 171 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 160 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 171 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 171 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 171 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  47.7 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 160 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 167 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 160 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  54.74 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 160 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 171 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 160 aa  158  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 169 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 161 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 		 160 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  48.28 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  46.29 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  51.75 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  46.99 
 
 		 163 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  47.67 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  48.99 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  50.6 
 
 		 167 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  51.46 
 
 		 171 aa  151  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.98 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  47.65 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 160 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  51.05 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  49.71 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  46.49 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 172 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 167 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 172 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 166 aa  148  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  48.37 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 179 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  50.89 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.16 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  51.22 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 161 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  47.89 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  46.11 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  44.97 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  41.71 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 171 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 169 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>