More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6593 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  100 
 
 
338 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  54.17 
 
 
346 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  52.54 
 
 
349 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  51.19 
 
 
348 aa  371  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  52.54 
 
 
349 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  51.04 
 
 
349 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  53.47 
 
 
353 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  52.96 
 
 
340 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  51.04 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  50.88 
 
 
358 aa  355  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  51.04 
 
 
339 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
345 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  51.04 
 
 
339 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
342 aa  351  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  51.34 
 
 
378 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  50.45 
 
 
350 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  51.8 
 
 
361 aa  346  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  49.55 
 
 
338 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  50.6 
 
 
360 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  50.74 
 
 
351 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  50.74 
 
 
351 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  49.55 
 
 
338 aa  338  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  49.25 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  49.11 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  50.45 
 
 
351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  50.45 
 
 
370 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  48.81 
 
 
349 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
351 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
352 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  47.51 
 
 
349 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  48.97 
 
 
350 aa  315  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  47.73 
 
 
355 aa  308  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  47.29 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
345 aa  294  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
352 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  45.78 
 
 
352 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
352 aa  291  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  44.14 
 
 
354 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
328 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  45.02 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  45.45 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
325 aa  282  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  43.98 
 
 
344 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  43.62 
 
 
339 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
326 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
344 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
389 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  45.34 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
344 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  45.14 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
326 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
330 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.23 
 
 
335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  42.23 
 
 
343 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
325 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
344 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
341 aa  264  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
343 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  41.92 
 
 
344 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  44.81 
 
 
358 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
349 aa  262  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.23 
 
 
343 aa  262  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  45.09 
 
 
322 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
325 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  43.48 
 
 
324 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  41.94 
 
 
345 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
331 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
326 aa  259  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  43.24 
 
 
345 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  43.89 
 
 
322 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.59 
 
 
343 aa  259  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  42.14 
 
 
326 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
345 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  44.58 
 
 
349 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
324 aa  255  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
331 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
345 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
345 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
345 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
326 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  40.94 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  41.06 
 
 
345 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  41.38 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  38.74 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2388  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
331 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.15 
 
 
331 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0071932  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
344 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
349 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
326 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
323 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>