More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6483 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  68.25 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  66.93 
 
 		 127 aa  177  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  64.52 
 
 		 132 aa  170  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  61.6 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  61.6 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  61.6 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  60.8 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  61.6 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  61.29 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  61.29 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  61.29 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  62.9 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  60.33 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  60.48 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  60.8 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  61.98 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  63.71 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  63.56 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  63.56 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  56.8 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  59.83 
 
 		 136 aa  153  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  46.55 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 263 aa  97.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 265 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 		 260 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 176 aa  87.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.94 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.94 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  32.26 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  31.45 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  34.43 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.43 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  32.71 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  32.71 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.63 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  30.97 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.5 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  37.5 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  37.5 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  37.5 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>