72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3723 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
337 aa  702    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  51.66 
 
 
528 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 
337 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  26.5 
 
 
327 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  27.3 
 
 
327 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  25.86 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  24.66 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  26.03 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  25.61 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 
348 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  25.34 
 
 
326 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  22.84 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  22.98 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  23.65 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  22.51 
 
 
316 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  21.43 
 
 
326 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  25.68 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  22.51 
 
 
316 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  24.32 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  23.29 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 
322 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  23.19 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  24.64 
 
 
379 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  23.58 
 
 
313 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  24.77 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  23 
 
 
323 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  23.53 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  22.41 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  22.54 
 
 
323 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  22.7 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  22.66 
 
 
316 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  24.41 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  26.42 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  24.3 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  22.6 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  22.6 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  24.31 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  22.54 
 
 
323 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  31.86 
 
 
320 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  23.47 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  22.54 
 
 
323 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  22.06 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  19.46 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  23 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  23.47 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  22.3 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  22.13 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  23.71 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  21.95 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  23.83 
 
 
330 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  22.26 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  24.32 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  24.53 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  21.99 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  24.21 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  23.86 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  22.01 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  20.39 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  25.99 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  25.61 
 
 
375 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  23.68 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  22.3 
 
 
316 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  21.01 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2313  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>