More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2595 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
301 aa  634    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  45.96 
 
 
296 aa  264  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.42 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  36.18 
 
 
294 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  38.83 
 
 
291 aa  208  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.74 
 
 
293 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.66 
 
 
305 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.68 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.21 
 
 
290 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.96 
 
 
291 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0299  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.97 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.36 
 
 
291 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  36.4 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.88 
 
 
289 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.43 
 
 
308 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3019  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.46 
 
 
300 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000114003  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.58 
 
 
310 aa  113  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.78 
 
 
306 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.87 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.84 
 
 
303 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.12 
 
 
301 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  26.92 
 
 
307 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.85 
 
 
303 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.66 
 
 
316 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.67 
 
 
289 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.71 
 
 
298 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.57 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.65 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.19 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.3 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0769  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.66 
 
 
300 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  22.1 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1520  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.53 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.38 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  22.1 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  26.42 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.74 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1693  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.13 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.18 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.46 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.01 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.05 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.16 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.34 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  20.07 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.39 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.86 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.36 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.17 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.56 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.19 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0981  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.02 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.205063  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.99 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.72 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0199  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.43 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3838  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.39 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.71 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.73 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.13 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.73 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.57 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  23.57 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  22.77 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.14 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4183  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.38 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.796584  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  24.44 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.6 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.65 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.37 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.35 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02288  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.69 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1279  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.69 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1291  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.69 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2514  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.69 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3609  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.69 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.426233 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02249  hypothetical protein  23.69 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.5 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.38 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.94 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.84 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2666  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.34 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2726  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.21 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  0.0936253 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.05 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  21.02 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.71 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.03 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2467  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  23.66 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161706  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1749  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.68 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000789005  normal  0.147651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2826  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.76 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.459146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2069  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  25.63 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0556368  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1236  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.26 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1831  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  24.23 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.164378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2529  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2746  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.34 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.41 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2213  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  24.69 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.354221  normal  0.272454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>