More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3651 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
122 aa  247  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  157  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  63.64 
 
 
120 aa  156  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
120 aa  150  6e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  58.2 
 
 
122 aa  145  1e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 
120 aa  146  1e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 
120 aa  145  2e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  54.1 
 
 
122 aa  145  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  144  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 
120 aa  144  4e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  143  7e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
124 aa  143  8e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  59.02 
 
 
120 aa  143  8e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
122 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.99642e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
122 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
122 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 
120 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
122 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
120 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  54.1 
 
 
119 aa  140  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
121 aa  140  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  57.14 
 
 
125 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  54.92 
 
 
122 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 
122 aa  139  1e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
120 aa  139  1e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  57.38 
 
 
121 aa  139  2e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
120 aa  137  4e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  137  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 
122 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.52303e-10 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  53.78 
 
 
121 aa  134  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.58089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
121 aa  133  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
121 aa  133  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.81328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
119 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
119 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 
119 aa  132  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.39 
 
 
124 aa  131  2e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 
119 aa  132  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  55.74 
 
 
121 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 
118 aa  130  4e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
122 aa  130  4e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 
122 aa  131  4e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
114 aa  130  4e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 
119 aa  130  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  64.65 
 
 
113 aa  130  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  51.69 
 
 
118 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  51.61 
 
 
124 aa  130  7e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
120 aa  130  7e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 
122 aa  130  7e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
120 aa  130  7e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
120 aa  130  7e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 
122 aa  130  8e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 
122 aa  129  1e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
118 aa  129  1e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 
122 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 
118 aa  128  2e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  59.6 
 
 
120 aa  128  2e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  53.39 
 
 
121 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  51.35 
 
 
122 aa  127  5e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  62.63 
 
 
123 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  57.38 
 
 
122 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.1695e-07  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  51.59 
 
 
118 aa  127  7e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
121 aa  126  8e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  55.46 
 
 
120 aa  126  1e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
115 aa  125  1e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
121 aa  125  2e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 
122 aa  124  4e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  52.94 
 
 
123 aa  124  4e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  52.68 
 
 
124 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  59 
 
 
121 aa  123  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  7.37084e-06  hitchhiker  6.40833e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  54.87 
 
 
122 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  57.43 
 
 
122 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  50.82 
 
 
122 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  1.28953e-05 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  52.21 
 
 
136 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  59.6 
 
 
121 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  50 
 
 
122 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  9.83895e-07 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  50.91 
 
 
122 aa  120  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 
120 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
120 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 
120 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
121 aa  120  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  50 
 
 
127 aa  120  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  119  1e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  4.32903e-05  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  53.51 
 
 
120 aa  119  1e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  49.19 
 
 
119 aa  119  2e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  57.28 
 
 
122 aa  118  2e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  47.97 
 
 
119 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  50.45 
 
 
120 aa  117  4e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  54.13 
 
 
134 aa  117  4e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 
120 aa  117  4e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  51.35 
 
 
121 aa  117  4e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  117  5e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>