125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1653 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1653  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 143 aa  297  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000451029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  31.45 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.62 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  26.62 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  26.62 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  32.52 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.52 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.16 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  29.75 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  28.8 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  28.06 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  29.71 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  28.47 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  30.88 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.2 
 
 		 722 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 941 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  28.03 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.09 
 
 		 515 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  27.01 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.76 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  29.46 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  28.77 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.09 
 
 		 515 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.2 
 
 		 926 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  26.96 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  26.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.69 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  31.97 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  27.41 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  27.41 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  22.48 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 689 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  34.44 
 
 		 372 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  32.65 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  25.71 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.15 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  26.67 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.75 
 
 		 768 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  27.94 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.37 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  23.39 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  25 
 
 		 631 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  28.03 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  25.81 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  25.81 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  28.83 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.19 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  27.61 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0606  GGDEF family protein  25 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.369805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  26.67 
 
 		 368 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  26.43 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  24.78 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.03 
 
 		 994 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  24.22 
 
 		 596 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.58 
 
 		 518 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0266  hypothetical protein  26.4 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  26.76 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.77 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  28.1 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  28.09 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  27.27 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  23.31 
 
 		 681 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  23.08 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.8 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  28.68 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.68 
 
 		 1004 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3626  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.8 
 
 		 840 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.41 
 
 		 662 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  28.09 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.9 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>