200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1646 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  100 
 
 
166 aa  341  3e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  84.34 
 
 
166 aa  300  7e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  81.33 
 
 
166 aa  295  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  81.33 
 
 
166 aa  291  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  81.93 
 
 
166 aa  289  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  75.76 
 
 
165 aa  265  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  71.52 
 
 
165 aa  254  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  69.09 
 
 
165 aa  241  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  59.04 
 
 
166 aa  211  3e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  57.23 
 
 
166 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  56.02 
 
 
166 aa  201  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  56.02 
 
 
166 aa  199  1e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  55.15 
 
 
164 aa  174  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  51.52 
 
 
166 aa  173  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  50.3 
 
 
166 aa  171  3e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  51.53 
 
 
166 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  52.12 
 
 
168 aa  167  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  50.3 
 
 
166 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  52.1 
 
 
164 aa  163  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  52.6 
 
 
166 aa  163  1e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  53.21 
 
 
166 aa  163  1e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  50.6 
 
 
165 aa  162  2e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  53.05 
 
 
172 aa  161  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  52.69 
 
 
164 aa  160  5e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  49.09 
 
 
168 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  51.22 
 
 
168 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  51.95 
 
 
166 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  48.12 
 
 
166 aa  155  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  52.1 
 
 
165 aa  153  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  49.68 
 
 
158 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  48.19 
 
 
168 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  46.58 
 
 
165 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  49.4 
 
 
164 aa  152  3e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  48.19 
 
 
166 aa  152  3e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  45.12 
 
 
165 aa  151  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  47.56 
 
 
168 aa  150  6e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  43.29 
 
 
167 aa  147  1e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  46.51 
 
 
185 aa  145  2e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  49.09 
 
 
167 aa  146  2e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  44.79 
 
 
167 aa  144  4e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  46.67 
 
 
170 aa  144  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  43.48 
 
 
165 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  46.67 
 
 
170 aa  142  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  46.67 
 
 
170 aa  142  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  46.39 
 
 
163 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  46.58 
 
 
167 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  50 
 
 
163 aa  141  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  42.53 
 
 
184 aa  139  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  46.15 
 
 
185 aa  139  2e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  44.79 
 
 
173 aa  139  2e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  49.08 
 
 
169 aa  138  4e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  46.91 
 
 
164 aa  137  8e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  44.38 
 
 
168 aa  134  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  41.18 
 
 
184 aa  134  6e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  40.8 
 
 
184 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  42.35 
 
 
182 aa  130  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  40.24 
 
 
169 aa  130  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  41.92 
 
 
169 aa  128  4e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  43.2 
 
 
182 aa  127  7e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  40.62 
 
 
166 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  40.83 
 
 
182 aa  119  1e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  39.88 
 
 
184 aa  113  1e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  42.95 
 
 
233 aa  112  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  44.03 
 
 
179 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  40.48 
 
 
228 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  43.95 
 
 
178 aa  111  4e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.95 
 
 
178 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  40.13 
 
 
178 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  41.51 
 
 
179 aa  105  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  42.86 
 
 
179 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  42.77 
 
 
177 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  40.25 
 
 
216 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.15937e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  41.07 
 
 
202 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  42.31 
 
 
178 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  44.62 
 
 
168 aa  101  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  41.67 
 
 
179 aa  101  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  39.88 
 
 
202 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.67 
 
 
221 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  42.26 
 
 
202 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  36.93 
 
 
263 aa  99.4  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  39.05 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  45.8 
 
 
140 aa  99  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  44.62 
 
 
140 aa  98.6  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  41.03 
 
 
178 aa  98.2  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  41.92 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  43.51 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  43.18 
 
 
140 aa  97.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  46.46 
 
 
140 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  43.85 
 
 
139 aa  97.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>