24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0994 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  100 
 
 		 165 aa  342  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  51.68 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  38.01 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  51.89 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  44.9 
 
 		 138 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  41.74 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  43.3 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  41.84 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  47.83 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  46.88 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  38.39 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  48.51 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  39.09 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  41.58 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  39.82 
 
 		 139 aa  101  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  34.11 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  44.34 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  34.69 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1329  hypothetical protein  23.97 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0345562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  30 
 
 		 102 aa  51.6  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  26.67 
 
 		 111 aa  47.8  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  29.2 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 355 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>