14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3864 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  100 
 
 
162 aa  338  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  60.74 
 
 
163 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  60.12 
 
 
163 aa  214  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  65.52 
 
 
215 aa  202  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  57.14 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  56.6 
 
 
170 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  56.6 
 
 
186 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  48.41 
 
 
170 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  46.01 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  44.44 
 
 
160 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  44.44 
 
 
160 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  30.38 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  37.18 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  29.2 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>