19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3863 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  100 
 
 
165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  47.5 
 
 
165 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  36.72 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  36.07 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  36.07 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  33.54 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  34.27 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  34.82 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  35.96 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  36.7 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  32.74 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  33.57 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  38.3 
 
 
215 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  31.63 
 
 
111 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  31.46 
 
 
111 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  31.46 
 
 
111 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  30.85 
 
 
110 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1010  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  28.71 
 
 
300 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  26.6 
 
 
111 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>