14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2686 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  100 
 
 
161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  60.62 
 
 
163 aa  208  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  60.62 
 
 
163 aa  207  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  57.14 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  59.86 
 
 
215 aa  187  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  52.6 
 
 
170 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  50 
 
 
186 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  44.72 
 
 
161 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  42.77 
 
 
170 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  43.48 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  43.48 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  34.81 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  31.58 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  29 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>