16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2146 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  87.65 
 
 		 170 aa  318  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  64.12 
 
 		 170 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  56.6 
 
 		 162 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  49.07 
 
 		 163 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  50.3 
 
 		 215 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  48.45 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  50 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  40.49 
 
 		 161 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  44.06 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  44.06 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  35.14 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  35.64 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.2 
 
 		 351 aa  41.6  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>