13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4309 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  100 
 
 
160 aa  333  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  100 
 
 
160 aa  333  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  72.5 
 
 
161 aa  246  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  45.34 
 
 
163 aa  157  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  45.96 
 
 
163 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  44.44 
 
 
162 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  43.48 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  45.21 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  44.06 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  40.76 
 
 
170 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  39.16 
 
 
170 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  36.07 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  28.57 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>