22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2156 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  42.98 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  31.97 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  40.65 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  30.25 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  30.83 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  30.08 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  31 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  27.69 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  24.67 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  22.3 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  28.29 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  24.59 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  21.67 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  22.47 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  27.59 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  26.32 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  28.66 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  24.64 
 
 		 243 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  25.62 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>